Hasonlóan a Peugeot és Citroën testvéreihez a Toyota Aygo is megújult a 2009-es évre. Az új modellek átalakított orrészükről ismerhetők fel leginkább, ahol a lökhárító és az azzal egyben lévő hűtőmaszk változott meg.
Nagyobb a központi hűtőnyílás, de két újabbat is kialakítottak az ütközőben, amitől a kocsi sportosabbnak látszik. Hátul viszont csak a lámpák mások, amelyekben krómdíszítés jelent meg. A 2009-es modellekhez új színek és dísztárcsák is választhatók.
Belül néhány új kárpit, a kissé átalakított kalaptartó, valamint a klímavezérlés ábráinak is világításának cseréje említhető meg.
Továbbra is két motorral készül az Aygo. Az 1,4-es dízel változatlan, de az 1,0 literes benzinesen dolgoztak egy kicsit. Az ötfokozatú manuális váltóval szerelt 68 LE-s benzinmotor fogyasztását 0,1 literrel sikerült csökkenteni, most 4,5 liter 100 kilométerenként.
